Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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