Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms