Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms