Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms