Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp9bP98195 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms