Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Cited1P97769 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cited1P97769 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms