Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SgcaP82350 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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