Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms