Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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