Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp7P70280 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp7P70280 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms