Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms