Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UbdP63072 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms