Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp1P55194 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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