Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pex2P55098 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pex2P55098 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms