Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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