Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkn1bP46414 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms