Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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