Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtbP41155 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtbP41155 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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