Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TtlP38585 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TtlP38585 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtlP38585 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms