Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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