Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HexaP29416 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HexaP29416 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HexaP29416 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HexaP29416 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms