Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxrgP28705 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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