Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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