Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd12P23812 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms