Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms