Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms