Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P20040 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P20040 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P20040 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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