Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18532 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18532 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18532 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms