Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcnaP17918 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcnaP17918 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms