Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd5P13379 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd5P13379 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms