Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06335 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06335 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P06335 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06335 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06335 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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