Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01797 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01797 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01797 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms