Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccl20O89093 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccl20O89093 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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