Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms