Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Kcnk3O35111 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Kcnk3O35111 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Kcnk3O35111 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Kcnk3O35111 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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