Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC117090L7N257 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC117090L7N257 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC117090L7N257 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC117090L7N257 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC117090L7N257 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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