Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms