Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5458L7N219 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5458L7N219 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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