Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms