Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3tc1G3X9F6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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