Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r167G3UW71 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms