Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp988F6VKC7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms