Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Defa35E9QLQ1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa35E9QLQ1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms