Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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