Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9972E9Q053 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms