Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm3298E9PW80 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3298E9PW80 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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