Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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