Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Usf3B2RUQ2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Usf3B2RUQ2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms