Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms