Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms